Новая информация для подпроцессов SP2 и SP2.1. (Песляк, Короткий 2021).
В рамках YN-модели патогенеза эти два подпроцесса играют ключевую роль:
Подпроцесс SP2. Рост популяций Gram(-) TLR4-активных и Gram+ NOD2-активных бактерий в тонкокишечном микробиоме.
Подпроцесс SP2.1. Рост популяций псорагенных PsB. (подчиненный SP2)
Streptococcus sp. практически всегда присутствуют в тонкокишечном микробиоме. Они составляют его существенный % и в норме и при СИБР. Это факт впервые был подтвержден исследованиями группы REIMAGINE (см. раздел A2.8 и таблицу А5 в дополнениях к (Песляк, Короткий 2021).
Это подтверждено новой публикацией этой же группы REIMAGINE на гораздо большем контингенте. Было выполнено обследование 12-типерстной кишки с аспирацией биоматериала. Для биоматериала был выполнен культуральный посев (в т.ч. на Макконкей агаре), а также 16S rRNA секвенирование и полногеномное секвенирование (для небольшой части участников).
От 20 до 35% тонкокишечного микробиома составляют Streptococcus sp. Обследование охватило 483 (385+98) участников, диагноз тонкокишечный СИБР (ОМЧ более 10e3 КОЕ/мл) был поставлен для 98 участников. Для 32 участников ОМЧ был более 10e5 КОЕ/мл. (Leite 2024), Таблица 1, рис.2 – после заголовка этой заметки).
В этой же работе подчеркивается, что наличие СИБР коррелирует с существенным ростом % присутствия рода Klebsiella (из семейства Enterobacteriaceae), а именно двух видов Klebsiella aerogenes и Klebsiella pneumoniae. А также двух штаммов Escherichia coli (из семейства Enterobacteriaceae). А именно Escherichia coli K-12 и Escherichia coli BL21(DE3)
Эти 2 вида и 2 штамма являются TLR4-активными, поскольку имеют гены LpxL и LpxM, т.е. имеют LPS c липидом А с шестью ацильными цепями (hexa-acyled). Все штаммы (и подштаммы), геномы которых есть в БД https://www.kegg.jp/, имеют эти гены.
Именно TLR4-активные тонкокишечные бактерии обеспечивают поступление такого LPS, который активно взаимодействует с TLR4 рецептором фагоцитов (в частности нейтрофилов). Такой LPS активизирует нейтрофилы крови и ускоряет их переход в преднетозное состояние.
Аналогичные результаты по % присутствию Streptococcus sp. в тонкокишечном микробиоме получены в (Wang 2024). Больший % присутствия вероятно связан с тем, что забор биоматериала осуществлялся в пассивную капсулу в просвете кишки. А при аспирации биоматериал, как правило, забирается вблизи тонкокишечной стенки (иногда с предварительным смывом). (Рис.2 B)
Основные две цели при лечении тонкокишечного СИБР.
Цель 1 – привести концентрацию Streptococcus sp. в тонкокишечном микробиоме (как и других предполагаемо псорагенных бактерий) к норме (т.е. не выше чем 10e3 КОЕ/мл).
Цель 2 – максимальное устранить TLR4-активные бактерии в тонкокишечном микробиоме.
Библиография
Leite G., Rezaie A., Mathur R. at al. Defining Small Intestinal Bacterial Overgrowth by Culture and High Throughput Sequencing. Throughput Sequencing. Clin Gastroenterol Hepatol. 2024 Feb;22(2):259-270 PMID 37315761.
doi: https://doi.org/10.1016/j.cgh.2023.06.001
Wang G., Menon S., Wilsack L. at al. Spatially and temporally precise microbiome profiling in the small intestine using the SIMBA capsule with X-ray tracking. Frontiers in Microbiomes, 2024, v. 3,
doi: https://doi.org/10.3389/frmbi.2024.1321624
Песляк М.Ю., Короткий Н.Г. “Псориаз как нетопатия. Модель патогенеза с уникальной ролью нетоза.” , 2021, 78 c, ISBN 9785905504075,
DOI: https://doi.org/10.5281/zenodo.4065535