Псорагенные бактерии и Усиливающие бактерии

Раздел Примечание
Раздел 1.
Бактерии предполагаемые псорагенными и Таблица 1
На основе работы (Песляк & Короткий 2021).
Раздел 2.
Таблица 2. Gram(-) TLR4-активные бактерии ЖКТ
(усиливающие
действие псорагенных).
На основе работ (Песляк & Короткий 2021,  Песляк 2026).
Раздел 3.
Таблица 3.  Зависимость тяжести псориаза от концентрации бактерий в тонкокишечном микробиоме (условно).
Из работы (Песляк 2026)
Раздел 4.
Таблица 4. Основные цели при корректировке тонкокишечного микробиома.

Библиография

.

Раздел 1.

В Таблице 1 составлен перечень всех бактерий, предполагаемых псорагенными.
Это все виды
Streptococcus, большинство видов Leuconostoc, Weissella и Oenococcus, а также часть видов Lactococcus.
Также
PsB есть среди нескольких видов других родов (в частности Enterococcus faecalis).
Все
PsB имеют пептидогликан (основа их клеточной оболочки) содержащий межпептидные мостики типа (L-Ala)-(L-Ala) и/или (L-Ser)-(L-Ala). Такой пептидогликан аналогичен пептидогликану патогенной бактерии Streptococcus pyogenes.

В рамках YN-модели патогенеза псориаза предполагается, что антиген, который вызывает неадекватную реакцию кожной иммунной системы, происходит из фрагментов межпептидных мостиков именно этого пептидогликана.
А попадает этот антиген в кожу внутри нейтрофилов крови, которые, во-первых,
эндоцитируют бактериальные продукты в крови, во-вторых, привлекаются в воспаленную кожу и, в-третьих, могут в воспаленной коже претерпевать нетоз (саморазрушение).

Формирование этих мостиков в пептидогликане обусловлено наличием энзимов типа murM и murN.
murM – энзим, обеспечивающий присоединение серина/аланина (первой аминокислоты начиная от Lys) при формировании межпептидного мостика у пептидогликана. При отсутствии этого энзима мостиков почти не будет. Что именно присоединяется (серин или аланин) зависит от аллели murM-гена.
murN – энзим, обеспечивающий присоединение аланина (второй аминокислоты начиная от Lys) при формировании межпептидного мостика у пептидогликана. При отсутствии этого энзима, мостик будет длиной в одну аминокислоту.
В разных бактериях формирование межпептидных мостиков обеспечивают различные murMN-гены. (Песляк & Короткий 2021).

По базе данных KEGG определены все виды бактерий (среди включенных в эту БД), которые имеют гены, обеспечивающие секрецию обоих энзимов, т.е. и типа murM и типа murN.

Таблица 1. PsB Gram+ бактерии предполагаемые псорагенными

Род/вид

Характеристика, источник поступления, примечание

Присутствие в микробиоме ЖКТ (%)

Комменсалы и условные патогены***

Enterococcus faecalis

Микробиом толстой кишки основной источник поступления в тонкую кишку.

Корреляция между E.faecalis и псориазом (Ely 2018, Ramírez-Boscá 2015, Memariani 2025,  Zhou 2022,  Гумаюнова 2016).

Тонкая кишка условный патоген (менее 1%).
Толстая кишка
комменсал
(не менее 1%)

(Krawczyk 2021).

Eubacterium sulci

Микробиом полости рта и ВДП.

Условный патоген

.

.

.

Lactococcus sp.

Некоторые виды используются при производстве ферментированных молочных продуктов.

Менее 1%.
Вероятно при потреблении ферментированных молочных продуктов или плохо приготовленных продуктов.  

Lactococcus carnosus

Говяжьи стейки (сырые)

Lactococcus formosensis

Ферментированные ростки брокколи

Lactococcus garvieae

Патоген для рыб, животных и (очень редко) для людей.

Lactococcus petauri

Патоген для некоторых животных

Lactococcus piscium

Патоген для рыб. Используется при консервации морепродуктов.

Lactococcus raffinolactis

Ферментирует раффинозу в молоке, используется при производстве ферментированных молочных продуктов.

.

.

.

Leuconostoc sp.

Род молочнокислых бактерий, которые применяются при ферментировании продуктов (молочных, мясных, овощных).

.

.

.

.

Менее 1%.
Вероятно при потреблении ферментированных или плохо приготовленных продуктов.
.

Leuconostoc carnosum

Охлажденное мясо

Leuconostoc citreum

Производство пищевых продуктов

Leuconostoc garlicum

Чеснок (на поверхности)

Leuconostoc gasicomitatum

Мясо птиц

Leuconostoc gelidum

Охлажденное мясо

Leuconostoc kimchii

Производство (ферментация) кимчхи (пекинская капуста)

Leuconostoc koreense

Производство (ферментация) кимчхи (пекинская капуста

Leuconostoc lactis

Производство молочных продуктов

Leuconostoc mesenteroides

Производство пищевых продуктов (молочные, мясные)

Leuconostoc pseudomesenteroides

Растительные или соевые ферментации

.

.

.

Oenococcus sp.

Яблочно-молочная ферментация, образование диацетила   компонента вин и сидра.

Менее 1%.
Вероятно (транзиторно) при потреблении вина/сидра.

Oenococcus oeni

Вино, сидр

Oenococcus sicerae

Сидр

.

.

.

Streptococcus sp.

Oральный микробиом (всегда включает стрептококки непатогенных видов) или молочные продукты.

.

Корреляция между стрептококками и псориазом (Песляк 2021, Sitton 2024).

Тонкая кишка: Комменсалы, условные патогены
до 20% (Leite 2024).

Толстая кишка: Комменсалы менее 1%.

Кроме патогенных видов (Str.pyogenes, Str.agalactiae и Str.pneumoniae и др.), которые в норме отсутствуют.

.

.

.

Weissella sp.

Ферментированные продукты (кимчхи, квашеные овощи) или оральные пробиотики.

Менее 1%.
Вероятно при потреблении ферментированных продуктов или оральных пробиотиков.

Weissella ceti

Микробиом рыб

Weissella cibaria

Оральный микробиом. Производство оральных пробиотиков.

Weissella hellenica

Ферментирование мяса и овощей (корейские и японские продукты)

Weissella jogaejeotgali

Ферментированные рыбные продукты

Weissella koreensis

Ферментированные продукты (кимчхи, хлеб, водоросли).

Weissella paramesenteroides

Ферментированные продукты (молочные, мясные, овощные).

Weissella viridescens

Ферментированные продукты

.

Маловероятные для микробиома ЖКТ

Arthrobacter sp.PGP41

Бактерия, стимулирующая рост растений.

Крайне маловероятно

Enterococcus silesiacus

Питьевая вода, ЖКТ животных

Маловероятно

.

Furfurilactobacillus rossiae L1

Молочнокислая бактерия

Маловероятно

.

Melissococcus plutonius

Патоген насекомых т.ч. медоносных пчел)

Крайне маловероятно

Pseudarthrobacter psychrotolerans

Почва корней травянистых растений

Крайне маловероятно

Pseudarthrobacter sulfonivorans

Почва корней травянистых растений

Крайне маловероятно

Weissella coleopterorum

Микробиом насекомых

Маловероятно

Weissella diestrammenae

Микробиом насекомых

Маловероятно

Weissella soli

Почва

Маловероятно

Weissella tructae

Микробиом рыб

Маловероятно


Раздел 2.

Таблица 2. Gram(-) TLR4-активные бактерии ЖКТ
(усиливающие действие псорагенных).

Род/вид

Тонкая кишка

Толстая кишка

Источники**

Комменсалы и условные патогены***

Alistipes

комменсал, редко

комменсал

SP

Bacteroides*

комменсал
(чаще
дистально)

доминирующий комменсал

SP, ОТ

Escherichia coli

комменсал, но есть патогенные штаммы

B, ST, SP

Klebsiella*

условный патоген, комменсал

B, ST, SP

Parabacteroides

комменсал, редко

комменсал

SP

Proteus

условный патоген

B

Патогены и редкие (транзиторные) условные патогены для тонкой кишки

Aeromonas

условный патоген, редко

B

Burkholderia*

условный патоген, редко

OT

Campylobacter jejuni

патоген

D

Citrobacter*

условный патоген, редко

условный патоген, комменсал

B, SP

Edwardsiella*

патоген

B

Enterobacter cloacae

условный патоген, редко

условный патоген, комменсал

OT

Haemophilus*

условный патоген, редко

B

Morganella

условный патоген, редко

условный патоген, комменсал

B

Pantoea*

условный патоген, редко

B

Providencia

условный патоген, редко

условный патоген, комменсал

B

Pseudomonas aeruginosa

условный патоген, редко

ST

Raoultella

условный патоген, редко

условный патоген, комменсал

SP

Salmonella

патоген

B, ST

Serratia*

условный патоген, редко

условный патоген, комменсал

B, ST

Shewanella

условный патоген, редко

B

Shigella

патоген

B, SP

Vibrio

патоген, но есть непатогенные виды.

B

Примечания.
*
только некоторые виды.  
**
B имеют гены LpxL и LpxM согласно BioCyc,  D Di Lorenzo 2019,  ST Stephens 2020,  SP Spindler 2022,  OT другие источники.


***
Комменсал   безопасен и может приносить пользу.
Условный патоген безопасен, но может вызвать болезнь при избыточном росте и/или ослабленном иммунитете. Патоген вызывает болезнь.


.

Раздел 3.

Таблица 3.  Зависимость тяжести псориаза от концентрации бактерий в тонкокишечном микробиоме (условно).

Концентрация псорагенных бактерий

Концентрация усиливающих бактерий

в норме
(<=
10е3)

выше нормы (>10е3 и <= 10е5)

существенно выше нормы (>10е5)

в норме
(<=
10е3)

нет

слабый

средний

выше нормы (>10е3 и <= 10е5)

слабый

средний

средне-тяжелый

существенно выше нормы (>10е5)

средний

средне-тяжелый

тяжелый,
возможность
псориатического артрита


.

Раздел 4.

Таблица 4. Основные цели при корректировке тонкокишечного микробиома.

Цель 1. Патогены.
Полностью
устранить все обнаруженные патогены (независимо от рода и вида).

Цель 2. Псорагенные бактерии (Таблица 1).
2.1.
Сократить до минимума лучше исключить полностью) потребление пробиотиков и ферментированных продуктов, содержащих Enterococcus faecalis, Lactococcus sp., Leuconostoc sp., Oenococcus sp., Streptococcus sp., Weissella sp.

2.2. Привести концентрацию Streptococcus sp. к норме (т.е. не выше, чем 10e3 КОЕ/мл). Полностью устранить Streptococcus sp. невозможно, т.к. многие виды являются комменсалами для орального микробиома и постоянно пополняют тонкокишечный микробиом (особенно при пониженной кислотности желудка).

2.3.
Привести концентрацию прочих обнаруженных псорагенных бактерий (кроме Streptococcus sp.) до минимума (т.е. не выше, чем 10e3 КОЕ/мл), либо полностью устранить.

Цель 3. Усиливающие бактерии (Таблица 2).
Привести концентрацию обнаруженных бактерий до минимума (т.е. не выше, чем 10e3 КОЕ/мл), либо полностью устранить.


Библиография

Di Lorenzo F., De Castro C.,  Silipo A., Molinaro A. Lipopolysaccharide structures of Gram-negative populations in the gut microbiota and effects on host interactions. FEMS Microbiology Reviews, Volume 43, Issue 3, May 2019, Pages 257–272, doi: 10.1093/femsre/fuz002

Ely PH. Is psoriasis a bowel disease? Successful treatment with bile acids and bioflavonoids suggest it is.  Clin Dermatol. 2018 May Jun;36(3):376-389. PMID 29908580. doi: 10.1016/j.clindermatol.2018.03.011

Krawczyk B, Wityk P, Gałęcka M, Michalik M. The Many Faces of Enterococcus spp.-Commensal, Probiotic and Opportunistic Pathogen. Microorganisms. 2021 Sep 7;9(9):1900. PMID 34576796. doi:10.3390/microorganisms9091900

Leite G., Rezaie A., Mathur R. at al. Defining Small Intestinal Bacterial Overgrowth by Culture and High Throughput Sequencing. Throughput Sequencing. Clin Gastroenterol Hepatol. 2024 Feb;22(2):259-270 PMID 37315761.
doi: 10.1016/j.cgh.2023.06.001

Memariani M, Memariani H. New horizons in the treatment of psoriasis: Modulation of gut microbiome. Heliyon. 2025 Jan 3;11(1):e41672 PMID 39866422. doi:10.1016/j.heliyon.2025.e41672

Ramírez-Boscá A, Navarro-López V, Martínez-Andrés A, Such J, Francés R, Horga de la Parte J, Asín-Llorca M. Identification of Bacterial DNA in the Peripheral Blood of Patients With Active Psoriasis.  JAMA Dermatol. 2015 Jun;151(6):670-1. PMID 25760018. doi:10.1001/jamadermatol.2014.5585

Sitton B, Walker T, Mital R, Varra V, Kaffenberger J. Antistreptococcal treatment of psoriasis: a systematic review. Arch Dermatol Res. 2024 Jun 8;316(7):363. doi: 10.1007/s00403-024-03051-8. PMID: 38850287;

Spindler MP, Siu S, Mogno I. et al. Human gut microbiota stimulate defined innate immune responses that vary from phylum to strain. Cell Host Microbe. 2022 Oct 12;30(10):1481-1498.e5. PMID 36099923. doi:10.1016/j.chom.2022.08.009.

Stephens M, von der Weid PY. Lipopolysaccharides modulate intestinal epithelial permeability and inflammation in a species-specific manner. Gut Microbes. 2020 May 3;11(3):421-432. PMID 31203717. doi:10.1080/19490976.2019.1629235.

Zhou S., Yao Z.  Roles of Infection in Psoriasis. International journal of molecular sciences. 2022. vol. 23.   13. p. 6955. PMID 35805960. doi:10.3390/ijms23136955

Гумаюнова НГ, Нестеров АС, Потатуркина-Нестерова НИ. Cиндром избыточного роста бактерий в тонкой кишке и псориатическая болезнь. Монография. Ульяновск : УлГУ, 2016, 156 с. ISBN 9785888665923. elib.

Песляк М.Ю. Тонкокишечный СИБР Обнаружить и устранить!, MYPE, 2026. doi:10.5281/zenodo.18243569

Песляк М. Ю., Короткий Н. Г. Псориаз как нетопатия. Модель патогенеза с уникальной ролью нетоза. М.: АпА «Естественный путь», 2021. 78 с. ISBN 978-5-905504-07-5,. DOI: 10.5281/zenodo.4065535

.

Прокрутить вверх